[Materia Condensada] Consulta cálculo de frecuencias (y eventualmente espectros) vibracionales

[Veronica Vildosola]

Hola Fabio,
hace varios años usamos el PHON de Dario Alfe, que creo genera los POSCARs
que necesitas. Nosotros en su momento lo usamos con el Wien2k.
Fijate en http://www.homepages.ucl.ac.uk/~ucfbdxa/phon/

Y me diste una buena idea porque estamos teniendo un problema en un sistema
grande (de tiempo y memoria) para calcular con IBRION=5 que tal vez podemos
sortear asi.
Suerte, y si averiguo algo mas aviso.
Slds
Veronica



El vie., 11 oct. 2019 a las 16:41, <errico en fisica.unlp.edu.ar> escribió:

> Hola Fabio:
>
> Te recomoendo que le consultes a Arles, arlesv en fisica.unlp.edu.ar
>
> El ha hecho unos cuantos calculos en varios sistemas usando el quentum
> espresso. Es un espoecialista en erstas cosas. seguro te va a saber
> responder.
>
> Saludos!
>
> Leo
>
>
> > Hola a todos,
> >
> > Me permito usar esta lista para mandarles una consulta.
> >
> > Alguno conoce un programa del estilo de Phonopy
> > que (a diferencia de éste, al menos hasta donde yo entendí)
> > permita generar los archivos necesarios para luego usando un código
> > DFT (yo uso VASP) calcular las frecuencias vibracionales de un sistema de
> > átomos en la supercelda pero dejando fijos los otros ?
> >
> > Sería como hacer un cálculo con VASP con IBRION=5 pero en lugar que
> > vasp calcule primero las energías y fuerzas de las configuraciones
> > desplazadas,
> > una después de la otra para luego calcular las frecuencias,
> > lo que quisiera es usar un programa que genere el conjunto de POSCARs
> (uno
> > para cada desplazamiento) para ser calculados de manera independiente uno
> > del otro (single point calculations) lo cual es fácil de hacer por uno
> > mismo, Y que además (esto es lo que no tengo ganas de resolver a mano),
> > extraiga de los archivos de salida de cada cálculo single-point, calcule
> > la
> > matriz hessiana y luego las frecuencias.
> >
> > Esto es útil porque cuando hay que desplazar muchos átomos el cálculo de
> > frecuencias tal como lo hace VASP con IBRION=5, demora mucho y si por
> > haber
> > estimado mal el tiempo del cálculo al mandar el job al sistema de colas,
> > se corta el cálculo justo antes de terminar, hay que recomenzar de nuevo
> > si
> > uno no quiere tomarse el trabajo de hacer sólo los cálculos que quedaron
> > sin hacer y armar la matriz hessiana a mano y diagonalizarla con algún
> > código que haga eso.
> >
> > Mirando la documentación de Phonopy, este código no está pensado para
> > hacer
> > eso y hay que meterse a modificar cosas con el riesgo de meter la pata en
> > algo sin darse cuenta.
> > Si alguien conoce o dispone de un código que permita hacer esto que
> > describo, les agradeceré me pasen la información.
> >
> > Gracias desde ya !
> >
> > Saludos,
> > Fabio
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> Dr. Leonardo A. Errico
> Prof. Adjunto Universidad Nacional de La Plata.
> Prof. Titular Universidad Nacional del Noroeste de la Pcia. de Buenos
> Aires.
> Investigador Independiente CONICET.
> Departamento de Física - Facultad de Ciencias Exactas
> Universidad Nacional de La Plata.
> Instituto de Física La Plata (IFLP, CONICET).
> CC 67 - 1900 La Plata - ARGENTINA.
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