[Materia Condensada] Consulta =?iso-8859-1?Q?c=E1lculo_de_frecuencias_?=(y eventualmente espectros) vibracionales
errico en fisica.unlp.edu.ar
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Vie Oct 11 16:41:45 -03 2019
Hola Fabio:
Te recomoendo que le consultes a Arles, arlesv en fisica.unlp.edu.ar
El ha hecho unos cuantos calculos en varios sistemas usando el quentum
espresso. Es un espoecialista en erstas cosas. seguro te va a saber
responder.
Saludos!
Leo
> Hola a todos,
>
> Me permito usar esta lista para mandarles una consulta.
>
> Alguno conoce un programa del estilo de Phonopy
> que (a diferencia de éste, al menos hasta donde yo entendí)
> permita generar los archivos necesarios para luego usando un código
> DFT (yo uso VASP) calcular las frecuencias vibracionales de un sistema de
> átomos en la supercelda pero dejando fijos los otros ?
>
> Sería como hacer un cálculo con VASP con IBRION=5 pero en lugar que
> vasp calcule primero las energías y fuerzas de las configuraciones
> desplazadas,
> una después de la otra para luego calcular las frecuencias,
> lo que quisiera es usar un programa que genere el conjunto de POSCARs (uno
> para cada desplazamiento) para ser calculados de manera independiente uno
> del otro (single point calculations) lo cual es fácil de hacer por uno
> mismo, Y que además (esto es lo que no tengo ganas de resolver a mano),
> extraiga de los archivos de salida de cada cálculo single-point, calcule
> la
> matriz hessiana y luego las frecuencias.
>
> Esto es útil porque cuando hay que desplazar muchos átomos el cálculo de
> frecuencias tal como lo hace VASP con IBRION=5, demora mucho y si por
> haber
> estimado mal el tiempo del cálculo al mandar el job al sistema de colas,
> se corta el cálculo justo antes de terminar, hay que recomenzar de nuevo
> si
> uno no quiere tomarse el trabajo de hacer sólo los cálculos que quedaron
> sin hacer y armar la matriz hessiana a mano y diagonalizarla con algún
> código que haga eso.
>
> Mirando la documentación de Phonopy, este código no está pensado para
> hacer
> eso y hay que meterse a modificar cosas con el riesgo de meter la pata en
> algo sin darse cuenta.
> Si alguien conoce o dispone de un código que permita hacer esto que
> describo, les agradeceré me pasen la información.
>
> Gracias desde ya !
>
> Saludos,
> Fabio
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Dr. Leonardo A. Errico
Prof. Adjunto Universidad Nacional de La Plata.
Prof. Titular Universidad Nacional del Noroeste de la Pcia. de Buenos Aires.
Investigador Independiente CONICET.
Departamento de Física - Facultad de Ciencias Exactas
Universidad Nacional de La Plata.
Instituto de Física La Plata (IFLP, CONICET).
CC 67 - 1900 La Plata - ARGENTINA.
TE: 54 - 221 - 4230122/4247201/4246062
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