<div dir="ltr"><div>Hola Fabio, <br></div><div>hace varios años usamos el PHON de Dario Alfe, que creo genera los POSCARs que necesitas. Nosotros en su momento lo usamos con el Wien2k.<br></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif">Fijate en <a href="http://www.homepages.ucl.ac.uk/~ucfbdxa/phon/">http://www.homepages.ucl.ac.uk/~ucfbdxa/phon/</a></span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif"><br></span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif">Y me diste una buena idea porque estamos teniendo un problema en un sistema grande (de tiempo y memoria) para calcular con IBRION=5 que tal vez podemos sortear asi.</span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif">Suerte, y si averiguo algo mas aviso.</span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif">Slds</span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif">Veronica<br></span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif"><br></span></font></div><div><font size="2"><span style="font-family:sans-serif"><br></span></font></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">El vie., 11 oct. 2019 a las 16:41, <<a href="mailto:errico@fisica.unlp.edu.ar">errico@fisica.unlp.edu.ar</a>> escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hola Fabio:<br>
<br>
Te recomoendo que le consultes a Arles, <a href="mailto:arlesv@fisica.unlp.edu.ar" target="_blank">arlesv@fisica.unlp.edu.ar</a><br>
<br>
El ha hecho unos cuantos calculos en varios sistemas usando el quentum<br>
espresso. Es un espoecialista en erstas cosas. seguro te va a saber<br>
responder.<br>
<br>
Saludos!<br>
<br>
Leo<br>
<br>
<br>
> Hola a todos,<br>
><br>
> Me permito usar esta lista para mandarles una consulta.<br>
><br>
> Alguno conoce un programa del estilo de Phonopy<br>
> que (a diferencia de éste, al menos hasta donde yo entendí)<br>
> permita generar los archivos necesarios para luego usando un código<br>
> DFT (yo uso VASP) calcular las frecuencias vibracionales de un sistema de<br>
> átomos en la supercelda pero dejando fijos los otros ?<br>
><br>
> Sería como hacer un cálculo con VASP con IBRION=5 pero en lugar que<br>
> vasp calcule primero las energías y fuerzas de las configuraciones<br>
> desplazadas,<br>
> una después de la otra para luego calcular las frecuencias,<br>
> lo que quisiera es usar un programa que genere el conjunto de POSCARs (uno<br>
> para cada desplazamiento) para ser calculados de manera independiente uno<br>
> del otro (single point calculations) lo cual es fácil de hacer por uno<br>
> mismo, Y que además (esto es lo que no tengo ganas de resolver a mano),<br>
> extraiga de los archivos de salida de cada cálculo single-point, calcule<br>
> la<br>
> matriz hessiana y luego las frecuencias.<br>
><br>
> Esto es útil porque cuando hay que desplazar muchos átomos el cálculo de<br>
> frecuencias tal como lo hace VASP con IBRION=5, demora mucho y si por<br>
> haber<br>
> estimado mal el tiempo del cálculo al mandar el job al sistema de colas,<br>
> se corta el cálculo justo antes de terminar, hay que recomenzar de nuevo<br>
> si<br>
> uno no quiere tomarse el trabajo de hacer sólo los cálculos que quedaron<br>
> sin hacer y armar la matriz hessiana a mano y diagonalizarla con algún<br>
> código que haga eso.<br>
><br>
> Mirando la documentación de Phonopy, este código no está pensado para<br>
> hacer<br>
> eso y hay que meterse a modificar cosas con el riesgo de meter la pata en<br>
> algo sin darse cuenta.<br>
> Si alguien conoce o dispone de un código que permita hacer esto que<br>
> describo, les agradeceré me pasen la información.<br>
><br>
> Gracias desde ya !<br>
><br>
> Saludos,<br>
> Fabio<br>
> _______________________________________________<br>
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Dr. Leonardo A. Errico<br>
Prof. Adjunto Universidad Nacional de La Plata.<br>
Prof. Titular Universidad Nacional del Noroeste de la Pcia. de Buenos Aires.<br>
Investigador Independiente CONICET.<br>
Departamento de Física - Facultad de Ciencias Exactas<br>
Universidad Nacional de La Plata.<br>
Instituto de Física La Plata (IFLP, CONICET).<br>
CC 67 - 1900 La Plata - ARGENTINA.<br>
TE: 54 - 221 - 4230122/4247201/4246062<br>
FAX: 54 - 221 - 4252006<br>
e-mail: <a href="mailto:errico@fisica.unlp.edu.ar" target="_blank">errico@fisica.unlp.edu.ar</a><br>
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