[Materia Condensada] Consulta cálculo de frecuencias (y eventualmente espectros) vibracionales

[Heriberto Fabio busnengo]

Hola a todos,

Me permito usar esta lista para mandarles una consulta.

Alguno conoce un programa del estilo de Phonopy
que (a diferencia de éste, al menos hasta donde yo entendí)
permita generar los archivos necesarios para luego usando un código
DFT (yo uso VASP) calcular las frecuencias vibracionales de un sistema de
átomos en la supercelda pero dejando fijos los otros ?

Sería como hacer un cálculo con VASP con IBRION=5 pero en lugar que
vasp calcule primero las energías y fuerzas de las configuraciones
desplazadas,
una después de la otra para luego calcular las frecuencias,
lo que quisiera es usar un programa que genere el conjunto de POSCARs (uno
para cada desplazamiento) para ser calculados de manera independiente uno
del otro (single point calculations) lo cual es fácil de hacer por uno
mismo, Y que además (esto es lo que no tengo ganas de resolver a mano),
extraiga de los archivos de salida de cada cálculo single-point, calcule la
matriz hessiana y luego las frecuencias.

Esto es útil porque cuando hay que desplazar muchos átomos el cálculo de
frecuencias tal como lo hace VASP con IBRION=5, demora mucho y si por haber
estimado mal el tiempo del cálculo al mandar el job al sistema de colas,
se corta el cálculo justo antes de terminar, hay que recomenzar de nuevo si
uno no quiere tomarse el trabajo de hacer sólo los cálculos que quedaron
sin hacer y armar la matriz hessiana a mano y diagonalizarla con algún
código que haga eso.

Mirando la documentación de Phonopy, este código no está pensado para hacer
eso y hay que meterse a modificar cosas con el riesgo de meter la pata en
algo sin darse cuenta.
Si alguien conoce o dispone de un código que permita hacer esto que
describo, les agradeceré me pasen la información.

Gracias desde ya !

Saludos,
Fabio
------------ próxima parte ------------
Se ha borrado un adjunto en formato HTML...
URL: <http://lists.ing.unlp.edu.ar/pipermail/materiacondensada/attachments/20191011/34334ec1/attachment.html>